Partage de ressources bioinformatiques hétérogènes: conception et implémentation d'une fédération de médiateurs

  • Quentin Dallons
  • Pierre Buyle

Student thesis: Master typesMaster en sciences informatiques

Résumé

Le domaine d'application de la bioinformatique est aussi varié qu'hétérogène. Pour le biologiste moléculaire, la bioinformatique constitue un outil de travail permettant d'effectuer des traitements élémentaires sur des données personnelles. Aujourd'hui, la situation de la bioinformatique se résume plutôt à une collection de sites offrant des services donnant acc`es à des sources de données biologiques. Cependant, pour partager ces ressources et pour éviter la duplication systématique des sources de données, il devient impératif que les infrastructures offrant ces ressources communiquent de manière la plus efficace possible. Par ailleurs, récemment, beaucoup de solutions issues des TIC sont apparues et facilitent la distribution et la collaboration des syst`emes d'informations (ex: OMG CORBA, Microsoft .NET, Sun J2EE, Services Web, etc.). Laurent Debaisieux et Fernando Desouza, sous la direction de Vincent Englebert et de Marc Colet, ont conçu une fédération d'hôtes interconnectés permettant le partage de 'Ressources Bioinformatiques Hétérogènes'. Dans ce m'emoire, nous proposons un raffinement de l'architecture proposée par Laurent Debaisieux et Fernando Desouza en la rendant plus robuste et résistante à la montée en charge. Pour valider cette nouvelle architecture, nous proposons également un prototype.
la date de réponse2003
langue originaleFrançais
SuperviseurVincent Englebert (Promoteur)

mots-clés

  • federated system
  • mediator
  • genomic databases
  • BSA
  • corba

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