Rôle d'une modification post-transcriptionnelle de I' ARN dans le contrôle de la différenciation cellulaire (gamétogenèse)

Résumé

Depuis plusieurs décennies, il est connu que l'ARN peut être modifié. Ces modifications, dites « post-transcriptionnelles » , jouent des rôles structurels et biologiques qui sont encore peu compris. Le champ d'étude qui vise à étudier et comprendre l'impact moléculaire et cellulaire de ces modifications, tout en développant des techniques de séquençage spécifiques, est appelé « épitranscriptomique ». Ce mémoires 'intègre dans l'étude épitranscriptomique d' une modification correspondant à une forme réduite de l' uridine ; la dihydrouridine (D) . La dihydrouridine est la modification de l' ARN la plus abondante au sein des ARN de transfert, et est synthétisée par des enzymes nommées dihydrouridine synthases. Les expériences menées lors de ce mémoire s'articulent autour de deux objectifs. Premièrement, investiguer un effet biologique potentiel de la dihydrouridine en se basant sur un constat phénotypique préalable : un défaut de sporulation observé chez la levure de fission Schizosaccharomyces pombe, dans une souche délétée pour le gène codant pour l'enzyme dihydrouridine synthase 4 (Dus4). Un rôle potentiel de la dihydrouridine dans le phénomène de sporulation (gamétogénèse chez la levure) était alors envisageable. Deuxièmement, mettre au point une technique de séquençage, appelée « D-seq » , permettant la détection spécifique de cette modification post-transcriptionnelle pour l'appliquer à deux autres espèces modèles : Escherichia coli et Caenorhabditis elegans. Le but de la réalisation du D-seq pour ces deux autres organismes est de pouvoir comparer phylogénétiquement la conservation des positions
de la dihydrouridine au sein du transcriptome. Les résultats des expériences et mises au point réalisés suggèrent que le défaut observé dans la sporulation chez Schizosaccharomyces pombe est indépendant de la protéine Dus4, et que le Dseq
peut s'appliquer à deux autres espèces modèles à la biologie différente de Schizosaccharomyces pombe

la date de réponse	2018
langue originale	Français
L'institution diplômante	Universite de Namur
Superviseur	Damien Hermand (Promoteur)