Microarray-based detection for multidrug resistance in human by expression profiling of ABC transporter genes and for small B-cell non Hodgkin's lymphoma characterization
: Damier à ADN de faible densité pour la détection des gènes ABC transporteurs dans les tumeurs humaines et pour la caractérisation des lymphomes non Hodgkiniens à petites cellules B

Traduction de l'intitulé de la thèse: Evaluation de l'intérêt d'un nouvel outil diagnostique (damier à ADN ou biochips)en oncologie. Etude de la résistance des patients à la chimiothérapie et application au diagnostic de lymphomes particuliers.

Thèse de l'étudiant: Doc typesDocteur en Sciences

Résumé

La diversité des marqueurs utilisés pour le diagnostic est un nouveau défi dans la pratique médicale quotidienne. Une question se pose donc; comment pouvons-nous déterminer le profil d’expression génique d’une tumeur en utilisant une approche efficace et pratique à des buts cliniques ? Au cours de ces 6 dernières années, les damiers à ADN ont contribué de façon significative à l’amélioration des connaissances dans de nombreux domaines de la recherche biomédicale. Bénéficiant de l’expertise de la société EAT, nous avons développé deux damiers à ADN de faible densité permettant d’une part, l’étude de la résistance à la chimiothérapie induite par les ABC transporteurs, et d’autre part, d’évaluer l’intérêt de ce genre d’outil pour le diagnostique clinique des lymphomes non Hodgkiniens à petites cellules B. Dans un premier temps, nous avons évalué la spécificité et la reproductibilité du damier DualChip human ABC. Pour cela, nous avons comparé le profil d’expression génique de trois lignées cellulaires résistantes à une drogue donnée avec le profil d’expression génique de leur lignée parentale sensible à cette drogue. Les résultats que nous avons obtenus étaient en accord avec ceux préalablement décrits. En outre, nous avons détecté un profil expression d’un plus grand nombre de gènes ABC transporteurs que celui établi précédemment à partir de techniques conventionnelles. Afin d’étudier davantage l’intérêt de cet outil dans le domaine diagnostique, nous avons étudié le profil d’expression des gènes ABC dans des échantillons cliniques de leucémie myéloïde aiguë, leucémie lymphoblastique aiguë de type T chez l’enfant et de carcinomes mammaires provenant de patients adultes traités et non traités. Nous avons ainsi pu mettre en évidence l’expression de nouveaux gènes ABC transporteurs dans les leucémies de l’enfant. Nous avons également observé un niveau d’expression élevé de nombreux gènes ABC transporteurs tant dans les tumeurs mammaires traitées que non traitées. Dans la seconde partie de ce travail, nous avons évalué le potentiel des damiers à ADN de faible densité dans le diagnostic de 4 sous-types de lymphomes non Hodgkiniens à petites cellules B. Nous avons étudié le profil d’expression génique d’échantillons provenant de 71 patients. Une analyse supervisée à partir du profil d’expression de tous les gènes étudiés a ensuite été entreprise. Cette étude a permis de mettre en évidence un groupe de gènes permettant de différencier 75% des patients investigués. L’ensemble de nos résultats a démontré que le damier à ADN de faible densité est un outil prometteur pour le diagnostic moléculaire dans des domaines variés incluant la classification des tumeurs et la détection de la résistance aux drogues.
la date de réponse25 avr. 2006
langue originaleAnglais
L'institution diplômante
  • Universite de Namur
SuperviseurJose REMACLE (Promoteur), Carine MICHIELS (Jury), Michel Herin (Copromoteur), Andre BOSLY (Jury), Thomas Efferth (Jury) & Thierry MOLINA (Jury)

mots-clés

  • Damier à ADN de faible densité
  • Diagnostic
  • Résistance des patients à la chimiothérapie
  • ATP-Binding Cassette (ABC) transporteurs
  • Lymphome non-Hodgkiniens à petites cellules B

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