La régulation transcriptionnelle du développement post-embryonnaire chez le nématode Caenorhabditis elegans

  • Jérémy Franche

Student thesis: Master typesMaster en biochimie et biologie moléculaire et cellulaire

Résumé

Le domaine C-terminal (CTD) de l'ARN polymérase II est composé de répétitions d'un heptapeptide consensus Y1S2P3T4S5P6S7• La phosphorylation de ces résidus (notamment les sérines) assure le couplage entre la transcription et de la maturation des ARNm. La phosphorylation de la sérine 2 (S2) est une étape importante associée à l'élongation, à l'épissage et à la terminaison de la transcription. Cependant, des études récentes suggèrent que cette modification n'est pas indispensable pour la survie, en tous cas chez des organismes unicellulaires. Chez le nématode Caenorhabditis elegans la phosphorylation de la S2 est effectuée par la kinase CDK-12. La perte de fonction de cette kinase entraine chez le ver un arrêt développemental au stade Ll. Les embryons se développent correctement, éclosent mais sont incapable d'initier le développement larvaire. Un arrêt en LI est également observé en condition physiologique : lorsque les embryons éclosent en absence de nourriture, les larves stoppent leur développement au stade LI. Pour étudier le rôle de la phosphorylation de la S2, un mutant conditionnel de cdk-12 (cdk-12as) a été généré en utilisant un allèle « analogsensitive
». Ce mutant permet de spécifiquement inhiber la kinase CDK-12 simplement par l'ajout d' un inhibiteur synthétique analogue d'ATP, ce qui se traduit par un arrêt développemental au stade Ll. Une expérience d'ARNi à l'échelle du génome a été menée dans des conditions où Cdk-12 est inhibée avec l'objectif d'identifier des suppresseurs de l'arrêt. Sur environ 19000 gènes testés, 126 ont été positifs lors du criblage primaire et 34 ont été confirmés lors d'un second criblage.
Trois candidats rbr-2, pgl-1 et panl-2 ont été sélectionnés pour analyses complémentaires. Un mutant disrupté pour rbr-2 ne confirme pas la suppression observée en interférence ARN. L'analyse de nos résultats permet de proposer des hypothèses concernant le rôle de la phosphorylation du CTD dans le développement post-embryonnaire chez le nématode
la date de réponse2017
langue originaleFrançais
L'institution diplômante
  • Universite de Namur
SuperviseurDamien Hermand (Promoteur)

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