Génotypage de plantes micropropagées

: application de la technique AFLP

Résumé

L'AFLP est une technique de détection de marqueurs moléculaire basée sur l'amplification aléatoire de fragments issus de la restriction de l'ADN. Elle fournit de nombreux marqueurs en une seule réaction et permet d'établir des empreintes génétiques tout en étant nettement plus reproductible que la RAPD. Au cours de ce travail, nous avons adapté à l'ADN de rhododendron un protocole standard d'AFLP. Au terme de cette optimalisation, les cartes d'identité génétique de 133 variétés de rhododendrons fournis par la firme Bioplant in vitro ont été analysées. Ces cartes se présentent sous forme d'électrophorégrammes, les fragments amplifiés et marqués par une sonde fluorescente y sont visualisés sous forme de pics. Un standard interne de poids moléculaire permet d'en déterminer précisément le taille. L'ensemble de ces données a ensuite été traité par le logiciel Genotyperâ, permettant ainsi la création d'une matrice binaire basée sur la détection de pics dans des catégories prédéfinies de taille de fragments. Cette matrice a permis la création de deux types de dendrogrammes. Ces derniers ont rendu possible l'exploration des liens phylogénétiques existant entre les diverses variétés.

la date de réponse	1999
langue originale	Français
Superviseur	Pierre Van Cutsem (Promoteur)