Résumé
Les Brucella sont des pathogènes intracellulaires qui infectent les humains et autres mammifères. Il existe peu d'informations à propos des mécanismes de virulence de cette bactérie. Récemment, un système de sécrétion de type IV nommé VirB a été identifié chezBruce/la suis et semble être essentiel pour sa survie dans les macrophages. La région VirB code pour douze protéines : VirB 1 à 11 et l' orf12. Des homologues de ces protéines ont été trouvés et ils remplissent différentes fonctions dans d'autres bactéries comme la conjugaison, l'infection d'hôtes, le transfert de macromolécules et d'ADN. Nous avons suivi une approche bioinformatiques afin de prédire, sur base de la séquence primaire, des éléments structuraux et fonctionnels pour les douze protéines encodées par la
région VirB sur base de leur séquence primaire. Cette analyse est basée sur la similarité du système de sécrétion de type IV de Brucella suis avec d'autres systèmes homologues de bactéries dont celui de l'organisme modèle, Agrobacterium tumefaciens, qui induit des tumeurs par sécrétion de T-DNA dans la cellule végétale. Nous avons collecté les informations qui pouvaient être intéressantes pour une meilleure compréhension de la relation entre la structure de ces douze protéines et leurs fonctions et des éventuelles interactions entre elles. Nous avons effectué des recherches dans les banques de données pour trouver les séquences homologues des douze protéines (avec Blast N.R., EST, PDB), des alignements de séquences, des recherches de motifs, des prédictions de structures secondaires et des reconnaissances de repliement protéique. Au terme de ce travail, des prédictions de fonctions pour les protéines VirB1, VirB4 et VirB11 ont pu être renforcées et des arguments pour la résolution d'ambiguïté de localisation cellulaire pour les protéines VirB2, VirB5 et VirB9 ont été avancés. Certains composants du système de sécrétion de type IV nous ont semblé avoir des rôles plus importants dont la protéine VirB5. C'est ce composant qui serait impliqué dans la déviation du trafic intracellulaire de Brucella suis.
la date de réponse | 2000 |
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langue originale | Français |
Superviseur | Eric Depiereux (Promoteur) |