Résumé
Au sein du laboratoire, Brucella abortus, une α-proteobactérie de l’ordre Rhizobiales, a été étudiée afin de comprendre la nature des interactions entre le PG et la ME. Une liaison covalente a été détectée entre le PG et cinq outer membrane proteins (OMPs). Ces OMPs ont une prédiction de structure en tonneau β avec une extension N-terminale du côté périplasmique. Ces extensions N-terminales commencent par un tétrapeptide conservé (ADAI). La première alanine de ce tétrapeptide forme une liaison covalente avec un résidu d’acide mésodiaminopimélique (mesoDAP) du PG. Ce tétrapeptide est conservé dans plusieurs autres Rhizobiales, suggérant des interactions similaires entre les OMPs et le PG chez ces bactéries. Les LDts capables de former la liaison entre les OMPs et le PG, n’ont pas encore toutes été identifiées. Trois LDtsBa de B. abortus ont été identifiés comme favorisant la liaison covalente de l’Omp25 au PG.L’objectif général de ce mémoire était de déterminer si les interactions OMP-PG, identifiées chez B. abortus ainsi que les protéines formant ces interactions, sont conservées dans les autres Rhizobiales. Pour ce faire, nous avons étudié un organisme modèle de la famille des Rhizobiaceae, Agrobacterium tumefaciens.
Ce travail montre que le système d’interaction entre la ME et le PG maintenant l’intégrité de l’enveloppe, est conservé chez A. tumefaciens. En effet, les OMPs RopA2, OmpAt2 et RopB, ont été démontrées comme étant liées de façon covalente au PG par un système similaire à celui découvert chez B. abortus. A ce jour, aucune LDts d’A. tumefaciens n’a été identifiée comme étant capable de former la liaison des protéines au PG, mais la redondance fonctionnelle des
LDts est probable, car A. tumefaciens possède 14 gènes prédits pour coder des homologues de LDts. La conservation de la structure d’interaction ME et PG entre B. abortus et A. tumefaciens est donc manifeste, et permet de proposer que cette structure est partagée par de nombreuses Rhizobiales. Efin, lors des recherches d’homologies menées au cours de ce travail, trois nouvelle LDts prédites ont été identifiée pour B. abortus. La caractérisation partielle de l’une d’entre elles, LDtBa11, suggère que cette LDt est impliquée directement ou indirectement dans
le détachement des OMPs du PG.
| la date de réponse | 16 janv. 2020 |
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| langue originale | Français |
| L'institution diplômante |
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| Superviseur | Xavier De Bolle (Promoteur) |