Caractérisation structurale de fragments Fab et de peptides mimétiques de la chaîne O du LPS de Brucella sp

  • Benjamin Albertani

    Student thesis: Master typesMaster en sciences biologiques des organismes et écologie

    Résumé

    Une série de peptides mimotopes du LPS de Brucella ont été isolés au sein du Laboratoire d'Immunologie et de Microbiologie. Afin de comprendre les bases structurales du mode de liaison de peptides mimotopes à un anticorps monoclonal, une étude structurale par modélisation et par cristallographie des peptides ainsi que des anticorps a été réalisée. Nous nous sommes focalisés sur 4 peptides, reconnus par l'anticorps 6B3 (spécifique d'un épitope du LPS M-dominant de Brucella sp.), dont les séquences permettent de dégager un consensus. Ces peptides ont été modélisés par dynamique et mécanique moléculaire : 20 conformères par peptide, potentiellement représentatifs d'une série de conformations possibles ont été engendrés. Afin de mettre en évidence une conformation qui pourrait être celle qui est reconnue par l'anticorps 6B3, nous avons tenté de trouver des conformations communes entre ces peptides. Pour ce faire, nous avons superposé l'ensemble des conformères de chaque peptide et nous les avons comparés sur base du squelette carboné. D'autre part, ces peptides fusionnés à une protéine "porteuse" ainsi qu'un fragment Fab d'un autre anticorps utilisé pour l'isolement de peptides mimotopes (4F9) ont été cristallisés. Bien que les cristaux soient inutilisables pour la diffraction par rayons X du fait de leur petite taille et de leur caractère polycristallin, il est possible d'affiner les conditions de cristallisation. Ces approches préliminaires nous ont permis de définir des stratégies prometteuses. Les résultats obtenus par modélisation et par cristallographie pourront dès lors être utilisés pour l'amélioration de mimotopes peptidiques.
    la date de réponse1999
    langue originaleFrançais
    SuperviseurEric Depiereux (Promoteur)

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