Étude par AFLP-ADNc du profil de transcription induit chez Arabidopsis thaliana lors de l'élicitation par des fragments pectiques

Résumé

Dans le but de se défendre contre les attaques d'une grande gamme de pathogènes (virus, bactéries,champignons, nématodes, insectes,. . .), les plantes se sont équipées de substances chimiques et de barrières physiques aussi bien constitutives qu'induites. Afin de mettre en évidence l'activation ou, au contraire, la répression de gènes impliqués dans les mécanismes de défense des plantes, une technique l'étude différentielle de transcrits à été utilisée : l'AFLP-ADNc. Des cellules d'Arabidopsis thaliana ont été traitées (pendant 10', 30' et 1h) avec des oligogalacturonides (OGA) possédant un degré de polymérisation plus ou moins 9. Cette démarche a pour but de mimer l'action d'un pathogène qui, lorsqu'il entre en contact avec la cellule végétale, commence par dégrader la paroi cellulaire en libérant des fragments pectiques. Ces derniers constituent un signal de danger pour la cellule qui va activer ou réprimer certains gènes pour se défendre.Une sélection de paires d'amorces générant des sorties AFLP-ADNc exploitables a été effectuée et les paires d'amorces suivantes ont été retenues : E01-M03, E02-M02, E02-M04 et E04-M04. A partir du couple E04-M04, deux pics (150 pb et 614 pb), d'intensité de fluorescence relativement faible ont été identifiés comme appartenant à des fragments (TDF) présents dans la sortie contrôle (non élicitée) et absents dans la sortie test (élicitée). Ces TDF correspondraient donc à des gènes réprimés suite au traitement. Ces fragments n'ont malheureusement pas pu être clonés et séquencés. Cependant, un pic appartenant aux deux sorties (test et contrôle) obtenues avec le couple d'amorces E04-M04 a été sélectionné, et le fragment correspondant d'une taille de 404 pb a pu être cloné, séquencé et identifié. Il s'agit d'un fragment correspondant au gène de la 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase, une enzyme intervenant dans la voie de biosynthèse des acides gras.

la date de réponse	2005
langue originale	Français
Superviseur	Pierre Van Cutsem (Promoteur) & Marie Manguette (Copromoteur)