Elaboration de biopuces aptamériques destinées à l'identification et au typage des virus animaux

Le projet propose la mise au point de tests d'identification basés sur l'utilisation d'aptamères: chaque séquence primaire d'un oligonucléotide forme une structure tridimensionnelle spécifique, laquelle est susceptible de rentrer en interaction physique avec une structure moléculaire complémentaire, à la manière d'une interaction antigène-anticorps. De tels ligands oligonucléotides identifiés artificiellement in vitro sont dénommés "aptamères". Les recherches les plus récentes montrent que les aptamères nucléotidiques permettent d'atteindre des niveaux de spécificité et d'affinité pour leur cible supérieurs de plusieurs ordres de grandeur à ce qui est mesuré pour l'interaction antigène-anticorps.
L'objectif du projet est de fabriquer deux microdamiers aptamériques capables d'identifier la présence des différents virus dans des prélèvements d'origine biologique. Le premier sera dévolu à l'identification du virus de Newcastle et des différentes souches (H1 à H15) de virus influenza. Le second sera dévolu au diagnostic des maladies respiratoires et de la peste porcine, y compris le typage des différentes souches d'influenza. Le protocole de mise en oeuvre inclura obligatoirement un processing minimum de l'échantillon ne nécessitant ni multiplication préalable du pathogène, ni compétence sophistiquée, ni matériel onéreux, ni délais supérieurs à quelques minutes. La lecture du résultat se fera via un périphérique d'ordinateur spécialement conçu. Le microdamier visé, une fois produit en série, permettra de réaliser des diagnostics de qualité à un coût et en un temps significativement inférieurs à ce que permet l'état actuel de la technologie, y compris pour recenser les multiples souches d'influenza circulant au sein de populations comme l'avifaune.