Acquisition d'un nouveau spectromètre de masse dédicacé aux analyses protéomiques à l'UNamur

L’Université de Namur a récemment regroupé ses gros équipements en 8
plateformes technologiques, dont MaSUN, la plateforme de spectrométrie
de masse (MS) qui compte actuellement un MS pour les analyses de
petites molécules et un MS à haute résolution (HRMS) pour les analyses
protéomiques. L’objectif de cette demande est une contribution à l’achat
d’un nouvel HRMS, l’actuel ayant été acheté en 2009. Grâce à un staff
technique hautement expérimenté, cet équipement est utilisé de manière
intensive, pour des projets protéomiques très variés proposés par des
chercheurs de l’UNamur et d’autres universités. Mise à part une contribution
aux frais de maintenance et à l’achat des consommables, l’accès est gratuit
pour les chercheurs universitaires.
Le projet scientifique présenté ici est lié à 2 projets protéomiques sur les 21
actuellement supportés par MaSUN. En plus d’apporter des réponses à des
questions biologiques, ces projets visent également un développement
technologique dans le domaines des interactions acides nucléiquesprotéines.
Les méthodes de purification par affinité suivie d’identification
des protéines par MS (AP-MS) sont un défi technologique pour des
questions de sensibilité/spécificité liées à la faible abondance des protéines
régulatrices de la traduction et de la transcription. Nous avons réussi à
surmonter la plupart de ces difficultés en mettant au point une méthode
d’identification par MS d’un grand nombre de régulateurs transcriptionnels
capturés par une longue séquence d’ADN. Nous proposons ici 1) de
développer l’aspect quantitatif de cette méthode et 2) de l’adapter aux
protéines régulatrices interagissant avec l’ARN. Ce second objectif se
concentrera sur l’identification des protéines interagissant avec l’ARN du
virus de Schmallenberg, un virus qui utilise des mécanismes non classiques
pour sa transcription/ traduction.