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2020
2019

Interaction of POPC, DPPC, and POPE with the μ opioid receptor: A coarse-grained molecular dynamics study

Angladon, M-A., Fossépré, M., Leherte, L. & Vercauteren, D., 1 mars 2019, Dans : PLoS ONE. 14, 3, p. e0213646 19 p., e0213646.

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2018

Investigating Cyclic Peptides Inhibiting CD2-CD58 Interactions through Molecular Dynamics and Molecular Docking Methods

Leherte, L., Petit, A., Jacquemin, D., Vercauteren, D. & Adèle, L., 1 nov. 2018, Dans : Journal of computer-aided molecular design. 32, 11, p. 1295-1313 19 p.

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2017
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2016

Accessing the Free Energy Profile of a Ring Closure in a Proline-Catalyzed Reaction Using a Reactive Force Field

Hubin, P., Jacquemin, D., Leherte, L. & Vercauteren, D. P., 1 janv. 2016, Dans : Theoretical Chemistry Accounts. 135, 1, p. 1-10 10 p., 16.

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Multiscale Design of Coarse-Grained Elastic Network-Based Potentials for the μ Opioid Receptor

Fossépré, M., Leherte, L., Laaksonen, A. & Vercauteren, D. P., 1 sept. 2016, Dans : Journal of Molecular Modeling. 22, 9, 20 p., 227.

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Parameterization of the ReaxFF Reactive Force Field for a Proline-Catalyzed Aldol Reaction

Hubin, P., Jacquemin, D., Leherte, L. & Vercauteren, D. P., 4 sept. 2016, Dans : Journal of Computational Chemistry. 37, 29, p. 2564-2572 9 p.

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Reduced point charge models of proteins: Assessment based on molecular dynamics simulations

Leherte, L., 2016, Dans : Molecular Simulation. 42, 4, p. 289-304 16 p.

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2015

Formation and Structural, Energetic and Dynamic Properties of Cyclodextrin Host Tubes and Included Guest Molecules

Staelens, N., Leherte, L. & Vercauteren, D. P., 2015, Dans : Supramolecular Chemistry. 27, p. 90-109 21 p.

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Modeling of structural, energetic, and dynamic properties of few-atom silver clusters embedded in polynucleotide strands by using molecular dynamics

Staelens, N., Leherte, L., Champagne, B. & Vercauteren, D. P., 2 févr. 2015, Dans : ChemPhysChem. 16, 2, p. 360-369 10 p.

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On the Modularity of the Intrinsic Flexibility of the μ Opioid Receptor: A Computational study

Fossépré, M., Leherte, L., Laaksonen, A. & Vercauteren, D. P., 2015, Dans : PLoS ONE. 9, 12, 29 p., e115856.

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2014

Comparison of Reduced Point Charge Models of Proteins: Molecular Dynamics Simulations of Ubiquitin

Leherte, L. & Vercauteren, D. P., 2014, Dans : SCIENCE CHINA Chemistry. 57, 10, p. 1340-1354 15 p.

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Quantum Mechanical Investigations on the Role of Neutral and Negatively Charged Enamine Intermediates in Organocatalyzed Reactions

Hubin, P., Jacquemin, D., Leherte, L. & Vercauteren, D. P., 15 avr. 2014, Dans : Chemical physics. 434, p. 30 - 36 7 p.

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2013
2012

Ab initio quantum chemical and ReaxFF-based study of the intramolecular iminium-enamine conversion in a proline-catalyzed reaction

Hubin, P. O., Jacquemin, D., Leherte, L., André, J. M., van Duin, A. C. T. & Vercauteren, D. P., 9 août 2012, Dans : Theoretical Chemistry Accounts. 131, 8, p. 1-11 11 p.

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Smoothed Gaussian Molecular Fields: An Evaluation of Molecular Alignment Problems

Leherte, L. & Vercauteren, D., 1 janv. 2012, Dans : Theoretical Chemistry Accounts: Theory, Computation, and Modeling. 131, 8, p. 1259/1-16 16 p.

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2011

Implementation of a Protein Reduced Point Charge Model Toward Molecular Dynamics Applications

Leherte, L. & Vercauteren, D., 17 nov. 2011, Dans : Journal of physical chemistry A. 115, 45, p. 12531-12543 13 p.

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Theoretical Investigation of the Structure of Cyclodextrin Tubules

Staelens, N., Leherte, L. & Vercauteren, D., 2011, Dans : Chimie nouvelle. 107, p. 6-12 7 p.

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2009

Coarse Point Charge Models for Proteins from Smoothed Molecular Electrostatic Potentials

Leherte, L. & Vercauteren, D., 1 déc. 2009, Dans : Journal of Chemical Theory and Computation. 5, 12, p. 3279-3298 20 p.

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Confinement in Molecular Sieves: The Pioneering Physical Concepts

Lucas, A., Derycke, I., Lambin, P., Vigneron, J-P., Leherte, L., Elanany, M., Andre, J-M., Larin, A. & Vercauteren, D., 15 juin 2009, Dans : Journal of Molecular Catalysis A: Chemical. 305, 1-2, p. 16-23 8 p.

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2008

Can Descriptors of the Electron Density Distribution Help to Distinguish Functional Groups?

Burton, J., Meurice, N., Leherte, L. & Vercauteren, D., 1 oct. 2008, Dans : Journal of chemical information and modeling. 48, 10, p. 1974-1983 10 p.

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Collective Motions in Protein Structures: Applications of Elastic Network Models Built from Electron Density Distributions

Leherte, L. & Vercauteren, D., 1 juil. 2008, Dans : Computer physics communications. 179, p. 171-180 10 p.

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Collective Motions of Rigid Fragments in Protein Structures from Smoothed Electron Density Distributions

Leherte, L. & Vercauteren, D., 15 juil. 2008, Dans : Journal of Computational Chemistry. 29, 9, p. 1472-1489 18 p.

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2007

In Silico Molecular Similarity and Complementarity Based on the Electron Density

Becue, A., Burton, J., Dury, L., Hansenne, C., Larin, A., Latour, T., Leherte, L., Meurice, N., Petit, J. & Vercauteren, D., 2007, Dans : Chimie nouvelle. 94, p. 14-21 8 p.

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Structural, Energetic, and Dynamical Properties of Rotaxanes Constituted of α-Cyclodextrins and an Azobenzene Chain

Briquet, L., Staelens, N., Leherte, L. & Vercauteren, D., 1 juil. 2007, Dans : Journal of Molecular Graphics and Modelling. 26, p. 104-116 13 p.

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2006

Similarity measures based on gaussian-type promolecular electron density models: Alignment of small rigid molecules

Leherte, L., 30 nov. 2006, Dans : Journal of Computational Chemistry. 27, 15, p. 1800-1816 17 p.

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2005

Influence of Conformation on the Representation of Small Flexible Molecules at Low Resolution: Alignment of Endothiapepsin Ligands

Leherte, L., Meurice, N. & Vercauteren, D., 1 juil. 2005, Dans : Journal of computer-aided molecular design. 19, 7, p. 525-549 25 p.

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2004

Evaluation of the Protein Solvent-Accessible Surface Using Reduced Representations in terms of Critical Points of the Electron Density

Becue, A., Meurice, N., Leherte, L. & Vercauteren, D., 15 juil. 2004, Dans : Journal of Computational Chemistry. 25, 9, p. 1117-1126 10 p.

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Use of Electron Density Critical Points as Chemical Function-Based Reduced Representations of Pharmacological Ligands

Biname, J., Meurice, N., Leherte, L., Glasgow, J., Fortier, S. & Vercauteren, D., 1 juil. 2004, Dans : Journal of Chemical Information and Computer Sciences. 44, 4, p. 1394-1401 8 p.

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2003

Description of Protein-DNA Complexes in Terms of Electron-Density Topological Features

Becue, A., Meurice, N., Leherte, L. & Vercauteren, D. P., 1 déc. 2003, Dans : Acta crystallographica. Section D. Biological crystallography. 59, 12, p. 2150-2162 13 p.

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Structural Identification of Local Maxima in Low-Resolution Promolecular Electron Density Distributions

Leherte, L., Dury, L. & Vercauteren, D. P., 20 nov. 2003, Dans : Journal of physical chemistry A. 107, 46, p. 9875-9886 12 p.

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2002

Application of a Kohonen Neural Network to the Analysis of Data Regarding the Alkylation of Toluene with Methanol Catalyzed by ZSM-5 Type Zeolites

Petit, J., Zupan, J., Leherte, L. & Vercauteren, D. P., 1 nov. 2002, Dans : Computers and Chemistry. 26, 6, p. 557-572 16 p.

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2001

Dynamics of benzene in zeolite KL

Hansenne, C., Jousse, F., Leherte, L. & Vercauteren, D. P., 22 janv. 2001, Dans : Journal of Molecular Catalysis A: Chemical. 166, 1, p. 147-165 19 p.

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2000

Critical Point Representations of Electron Density Maps for the Comparison of Benzodiazepine-Type Ligands

Leherte, L., Meurice, N. & Vercauteren, D. P., 1 janv. 2000, Dans : Journal of Chemical Information and Computer Sciences. 40, p. 816-832 17 p.

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Linear dependence of the interaction energy on intramolecular distance for adsorbed or clustered diatomic molecules

Larin, A., Leherte, L., Vercauteren, D. P. & Trubnikov, D. N., 20 sept. 2000, Dans : Molecular physics. 98, 18, p. 1433-1439 7 p.

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1999

Multiresolution analysis of electron density maps

Leherte, L., 1 sept. 1999, Dans : Computer physics communications. 121, p. 688 1 p.

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1998

Approximation of the Mulliken-type charges for the oxygen atoms of all-siliceous zeolites

Larin, A. V., Leherte, L. & Vercauteren, D. P., 24 avr. 1998, Dans : Chemical Physics Letters. 287, 1-2, p. 169-177 9 p.

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Comparison of benzodiazepine-like compounds using topological analysis and genetic algorithms.

Meurice, N., Leherte, L. & Vercauteren, D. P., 1 janv. 1998, Dans : SAR and QSAR in environmental research. 8, 3-4, p. 195-232 38 p.

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Développement d'algorithmes génétiques originaux appliqués à la comparaison moléculaire et à l'élucidation de pharmacophore

Meurice, N., Leherte, L. & Vercauteren, D. P., 1 janv. 1998, Dans : Journal de Pharmacie de Belgique. 53, 2, p. 100-101 2 p.

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1997

Analysis of MD trajectories as a jump diffusion process: Butene isomers in zeolite types TON and MEL

Jousse, F., Leherte, L. & Vercauteren, D., 12 juin 1997, Dans : Journal of physical chemistry B. 101, p. 4717-4732 16 p.

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Analysis of Three-Dimensional Protein Images

Leherte, L., Glasgow, J., Baxter, K., Steeg, E. & Fortier, S., 1997, Dans : Journal of Artificial Intelligence Research. 7, p. 125-159 35 p.

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Critical-point analysis in protein electron-density map interpretation

Fortier, S., Chiverton, A., Glasgow, J. & Leherte, L., 1 janv. 1997, Dans : Methods in Enzymology. 277, p. 131-157 27 p.

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