Jérôme De Ruyck

  • 212 Citations
  • 9 h-Index
20042015
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Profil personnel

Domaines de compétence

In structural biochemistry:
Overexpression, purification (IMAC, gel filtration and anion/cation exchangers), characterization (Electrophoresis, mass spectrometry, crystallography, UV IR spectroscopies) of proteins.
Protein and ligands X-ray crystallography (in-house and synchrotron facilities)
Protein modeling, homology modeling, docking by molecular mechanics, Virtual screening (zinc)
Use of molecular modeling (InsightII, Gold, Discover3, Sybyl, PyMOL) and crystallography (CCP4 suite, XDS, Coot) specialised software's

Other skills:

Analysis, synthesis and communication (written or oral) of multidisciplinary scientific results. 12 publications in international journals such as Biochemistry, Proteins, Journal of Biological Chemistry, Biochemical and Biophysical Research Communication, Current Protein and Peptide Science, Current Enzyme Inhibition and Acta Cristallographica.

Languages:

French: Mother tongue
English: Fluent
Dutch: Good passive knowledge (oral or written), basic level in writing skills, lack of oral practice

IT:

Microsoft office suite (Word, Powerpoint, Excel)
Use of Linux (Kubuntu distribution)

Diplômes

Doctorat en Sciences Chimiques (Biochimie structurale)
Licencie en Sciences Chimiques

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  • 2 Profils similaires
Isomerases composés chimiques
isopentenyldiphosphate delta-isomerase composés chimiques
Thermus thermophilus Médecine et sciences de la vie
diphosphates Physique & Astronomie
Crystal structure composés chimiques
Crystallography composés chimiques
Terpenes composés chimiques
Enzymes composés chimiques

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Projets 2004 2014

Résultat de recherche 2004 2015

  • 212 Citations
  • 9 h-Index
  • 16 Article
  • 2 Article dans les actes d'une conférence/un colloque
  • 1 Revue de documentation
4 Downloads (Pure)
Heme Oxygenase-1
Molecular modeling
imidazoles
inhibitors
Conformations

Determination of kinetics and the crystal structure of a novel type 2 isopentenyl diphosphate: Dimethylallyl diphosphate isomerase from streptococcus pneumoniae

De Ruyck, J., Janczak, M. W., Neti, S. S., Rothman, S. C., Schubert, H. L., Cornish, R. M., Matagne, A., Wouters, J. & Poulter, C. D., 7 juil. 2014, Dans : ChemBioChem. 15, 10, p. 1452-8 7 p.

Résultats de recherche: Contribution à un journal/une revueArticle

Isomerases
Streptococcus pneumoniae
Crystal structure
Kinetics
Terpenes

How the second-order nonlinear optical response of the collagen triple helix appears: A theoretical investigation

de Wergifosse, M., de Ruyck, J. & Champagne, B., 24 avr. 2014, Dans : Journal of Physical Chemistry C. 118, 16, p. 8595-8602 8 p.

Résultats de recherche: Contribution à un journal/une revueArticle

collagens
Collagen
helices
Amides
amides

Tetartohedral twinning in IDI-2 from Thermus thermophilus: crystallization under anaerobic conditions

De Ruyck, J., Schubert, H. L., Janczak, M. W. & Poulter, C. D., 2014, Dans : Acta Crystallographica Section F:Structural Biology Communications. 70, 3, p. 347-9 3 p.

Résultats de recherche: Contribution à un journal/une revueArticle

Thermus thermophilus
diphosphates
Twinning
twinning
Crystallization

Inhibition studies on enzymes involved in isoprenoid biosynthesis. focus on two potential drug targets: Dxr and idi-2 enzymes

de Ruyck, J., Wouters, J. & Poulter, C. D., 1 juil. 2011, Dans : Current Enzyme Inhibition. 7, 2, p. 79-95 17 p.

Résultats de recherche: Contribution à un journal/une revueArticle

Biosynthesis
Terpenes
Isomerases
Phosphates
Enzymes

Activités 2004 2014

  • 25 Participation à une conférence, un congrès
  • 2 Participation à un atelier/workshop, un séminaire, un cours

248th ACS Meeting

Jérôme De Ruyck (Participant)
10 août 201414 août 2014

Activité: Types de Participation ou d'organisation d'un événementParticipation à une conférence, un congrès

11th International Conference on Biology and Synchrotron Radiation

Jérôme De Ruyck (Poster)
8 sept. 201311 sept. 2013

Activité: Types de Participation ou d'organisation d'un événementParticipation à une conférence, un congrès

7th Belgian Crystallography Symposium

Jérôme De Ruyck (Poster)
10 oct. 2012

Activité: Types de Participation ou d'organisation d'un événementParticipation à une conférence, un congrès

Data collection at SOLEIL

Jérôme De Ruyck (Orateur)
23 sept. 201224 sept. 2012

Activité: Types de Participation ou d'organisation d'un événementParticipation à une conférence, un congrès

241th ACS National meeting

Jérôme De Ruyck (Participant)
27 mars 201130 mars 2011

Activité: Types de Participation ou d'organisation d'un événementParticipation à une conférence, un congrès

Thèse

Etude du mode de liaison de composés coumariniques, inhibiteurs de thrombine

Auteur: De Ruyck, J., 2004

Superviseur: Durant, F. (Promoteur)

Thèse de l'étudiant: Master typesMaster en sciences chimiques

Etude structurale comparative des Isopentenyl Diphosphate Isomérases de type 1 et 2

Auteur: De Ruyck, J., 12 sept. 2008

Superviseur: Wouters, J. (Promoteur), Marchand, J. (Personne externe) (Jury), Charlier, P. (Personne externe) (Jury), Vercauteren, D. (Jury) & Vincent, S. (Jury)

Thèse de l'étudiant: Doc typesDocteur en Sciences