Influence des lipides sur les propriétés dynamiques du récepteur aux opioïdes µ

Research output: Contribution to conferencePoster

Abstract

Les récepteurs aux opioïdes, dont les structures ont été révélées en 2012, font partie des récepteurs couplés aux protéines G (RCPGs), cible de 50 % des médicaments sur le marché actuel [1]. Les propriétés structurales et fonctionnelles des protéines transmembranaires sont affectées par l'environnement lipidique [2]. Pour comprendre ces processus, les méthodes de dynamique moléculaire (DM) apportent de nombreux éclaircissements, des plus précises (tout-atomes) aux résolutions moins importante (gros-grains).
L'objectif du projet est de comprendre l'influence de la composition lipidique de la membrane sur les propriétés dynamiques de la protéine µ. Pour cela, nous avons comparé les paramètres issus des simulations de DM, pour des membranes avec ou sans protéine µ, composées de quatre lipides différents : la phosphatidylcholine (saturée et insaturée), la phosphatidyléthanolamine et le cholestérol. Notre étude a ainsi permis de mettre en évidence les interactions qui ont lieu avec les têtes lipidiques : la nature chimique de la choline et de l'éthanolamine change ces interactions autant que la surface accessible au solvant pour la protéine; ainsi que les chaînes lipidiques : par l'influence de l'insaturation sur la fluidité membranaire et donc les mouvements de la protéine.
A terme, notre ambition est de réaliser des simulations de DM avec la composition lipidique la plus proche de la réalité, la plus simple et la plus significative en terme d'interactions protéine/lipide, ceci afin de guider les expériences de docking et de montrer l'importance de l'interaction d'un lipide avec une protéine pour ses propriétés structurales et fonctionnelles.


Bibliographie :

[1] Manglik A., Kruse A., Kobilka T., Thian F., Mathiesen J., Sunahara R., Pardo L., Weis W., Kobilka B. and Granier S. (2012) Crystal structure of the mu-opioid receptor bound to a morphinan antagonist Nature 485: 321-327

[2] Jastrzebska B., Debinski A., Filipek S. and Palczewski K. (2011) Role of membrane integrity on G protein-coupled receptors: rhodopsin stability and function Progress in Lipid Research 50: 267-277
Original languageFrench
Publication statusPublished - 15 Nov 2013
Event7 th Annual Meeting of the SFMBBM doctoral school - Liège, Belgium
Duration: 15 Nov 201315 Nov 2013

Scientific committee

Scientific committee7 th Annual Meeting of the SFMBBM doctoral school
CountryBelgium
CityLiège
Period15/11/1315/11/13

Cite this

Angladon, M-A., Fossepre, M., Leherte, L., & Vercauteren, D. (2013). Influence des lipides sur les propriétés dynamiques du récepteur aux opioïdes µ. Poster session presented at 7 th Annual Meeting of the SFMBBM doctoral school, Liège, Belgium.
@conference{54484034b210417995faa72ed74210bb,
title = "Influence des lipides sur les propri{\'e}t{\'e}s dynamiques du r{\'e}cepteur aux opio{\"i}des µ",
abstract = "Les r{\'e}cepteurs aux opio{\"i}des, dont les structures ont {\'e}t{\'e} r{\'e}v{\'e}l{\'e}es en 2012, font partie des r{\'e}cepteurs coupl{\'e}s aux prot{\'e}ines G (RCPGs), cible de 50 {\%} des m{\'e}dicaments sur le march{\'e} actuel [1]. Les propri{\'e}t{\'e}s structurales et fonctionnelles des prot{\'e}ines transmembranaires sont affect{\'e}es par l'environnement lipidique [2]. Pour comprendre ces processus, les m{\'e}thodes de dynamique mol{\'e}culaire (DM) apportent de nombreux {\'e}claircissements, des plus pr{\'e}cises (tout-atomes) aux r{\'e}solutions moins importante (gros-grains).L'objectif du projet est de comprendre l'influence de la composition lipidique de la membrane sur les propri{\'e}t{\'e}s dynamiques de la prot{\'e}ine µ. Pour cela, nous avons compar{\'e} les param{\`e}tres issus des simulations de DM, pour des membranes avec ou sans prot{\'e}ine µ, compos{\'e}es de quatre lipides diff{\'e}rents : la phosphatidylcholine (satur{\'e}e et insatur{\'e}e), la phosphatidyl{\'e}thanolamine et le cholest{\'e}rol. Notre {\'e}tude a ainsi permis de mettre en {\'e}vidence les interactions qui ont lieu avec les t{\^e}tes lipidiques : la nature chimique de la choline et de l'{\'e}thanolamine change ces interactions autant que la surface accessible au solvant pour la prot{\'e}ine; ainsi que les cha{\^i}nes lipidiques : par l'influence de l'insaturation sur la fluidit{\'e} membranaire et donc les mouvements de la prot{\'e}ine.A terme, notre ambition est de r{\'e}aliser des simulations de DM avec la composition lipidique la plus proche de la r{\'e}alit{\'e}, la plus simple et la plus significative en terme d'interactions prot{\'e}ine/lipide, ceci afin de guider les exp{\'e}riences de docking et de montrer l'importance de l'interaction d'un lipide avec une prot{\'e}ine pour ses propri{\'e}t{\'e}s structurales et fonctionnelles. Bibliographie :[1] Manglik A., Kruse A., Kobilka T., Thian F., Mathiesen J., Sunahara R., Pardo L., Weis W., Kobilka B. and Granier S. (2012) Crystal structure of the mu-opioid receptor bound to a morphinan antagonist Nature 485: 321-327[2] Jastrzebska B., Debinski A., Filipek S. and Palczewski K. (2011) Role of membrane integrity on G protein-coupled receptors: rhodopsin stability and function Progress in Lipid Research 50: 267-277",
author = "Marie-Ange Angladon and Mathieu Fossepre and Laurence Leherte and Daniel Vercauteren",
year = "2013",
month = "11",
day = "15",
language = "Fran{\cc}ais",
note = "7 th Annual Meeting of the SFMBBM doctoral school ; Conference date: 15-11-2013 Through 15-11-2013",

}

Angladon, M-A, Fossepre, M, Leherte, L & Vercauteren, D 2013, 'Influence des lipides sur les propriétés dynamiques du récepteur aux opioïdes µ', 7 th Annual Meeting of the SFMBBM doctoral school, Liège, Belgium, 15/11/13 - 15/11/13.

Influence des lipides sur les propriétés dynamiques du récepteur aux opioïdes µ. / Angladon, Marie-Ange; Fossepre, Mathieu; Leherte, Laurence; Vercauteren, Daniel.

2013. Poster session presented at 7 th Annual Meeting of the SFMBBM doctoral school, Liège, Belgium.

Research output: Contribution to conferencePoster

TY - CONF

T1 - Influence des lipides sur les propriétés dynamiques du récepteur aux opioïdes µ

AU - Angladon, Marie-Ange

AU - Fossepre, Mathieu

AU - Leherte, Laurence

AU - Vercauteren, Daniel

PY - 2013/11/15

Y1 - 2013/11/15

N2 - Les récepteurs aux opioïdes, dont les structures ont été révélées en 2012, font partie des récepteurs couplés aux protéines G (RCPGs), cible de 50 % des médicaments sur le marché actuel [1]. Les propriétés structurales et fonctionnelles des protéines transmembranaires sont affectées par l'environnement lipidique [2]. Pour comprendre ces processus, les méthodes de dynamique moléculaire (DM) apportent de nombreux éclaircissements, des plus précises (tout-atomes) aux résolutions moins importante (gros-grains).L'objectif du projet est de comprendre l'influence de la composition lipidique de la membrane sur les propriétés dynamiques de la protéine µ. Pour cela, nous avons comparé les paramètres issus des simulations de DM, pour des membranes avec ou sans protéine µ, composées de quatre lipides différents : la phosphatidylcholine (saturée et insaturée), la phosphatidyléthanolamine et le cholestérol. Notre étude a ainsi permis de mettre en évidence les interactions qui ont lieu avec les têtes lipidiques : la nature chimique de la choline et de l'éthanolamine change ces interactions autant que la surface accessible au solvant pour la protéine; ainsi que les chaînes lipidiques : par l'influence de l'insaturation sur la fluidité membranaire et donc les mouvements de la protéine.A terme, notre ambition est de réaliser des simulations de DM avec la composition lipidique la plus proche de la réalité, la plus simple et la plus significative en terme d'interactions protéine/lipide, ceci afin de guider les expériences de docking et de montrer l'importance de l'interaction d'un lipide avec une protéine pour ses propriétés structurales et fonctionnelles. Bibliographie :[1] Manglik A., Kruse A., Kobilka T., Thian F., Mathiesen J., Sunahara R., Pardo L., Weis W., Kobilka B. and Granier S. (2012) Crystal structure of the mu-opioid receptor bound to a morphinan antagonist Nature 485: 321-327[2] Jastrzebska B., Debinski A., Filipek S. and Palczewski K. (2011) Role of membrane integrity on G protein-coupled receptors: rhodopsin stability and function Progress in Lipid Research 50: 267-277

AB - Les récepteurs aux opioïdes, dont les structures ont été révélées en 2012, font partie des récepteurs couplés aux protéines G (RCPGs), cible de 50 % des médicaments sur le marché actuel [1]. Les propriétés structurales et fonctionnelles des protéines transmembranaires sont affectées par l'environnement lipidique [2]. Pour comprendre ces processus, les méthodes de dynamique moléculaire (DM) apportent de nombreux éclaircissements, des plus précises (tout-atomes) aux résolutions moins importante (gros-grains).L'objectif du projet est de comprendre l'influence de la composition lipidique de la membrane sur les propriétés dynamiques de la protéine µ. Pour cela, nous avons comparé les paramètres issus des simulations de DM, pour des membranes avec ou sans protéine µ, composées de quatre lipides différents : la phosphatidylcholine (saturée et insaturée), la phosphatidyléthanolamine et le cholestérol. Notre étude a ainsi permis de mettre en évidence les interactions qui ont lieu avec les têtes lipidiques : la nature chimique de la choline et de l'éthanolamine change ces interactions autant que la surface accessible au solvant pour la protéine; ainsi que les chaînes lipidiques : par l'influence de l'insaturation sur la fluidité membranaire et donc les mouvements de la protéine.A terme, notre ambition est de réaliser des simulations de DM avec la composition lipidique la plus proche de la réalité, la plus simple et la plus significative en terme d'interactions protéine/lipide, ceci afin de guider les expériences de docking et de montrer l'importance de l'interaction d'un lipide avec une protéine pour ses propriétés structurales et fonctionnelles. Bibliographie :[1] Manglik A., Kruse A., Kobilka T., Thian F., Mathiesen J., Sunahara R., Pardo L., Weis W., Kobilka B. and Granier S. (2012) Crystal structure of the mu-opioid receptor bound to a morphinan antagonist Nature 485: 321-327[2] Jastrzebska B., Debinski A., Filipek S. and Palczewski K. (2011) Role of membrane integrity on G protein-coupled receptors: rhodopsin stability and function Progress in Lipid Research 50: 267-277

M3 - Poster

ER -

Angladon M-A, Fossepre M, Leherte L, Vercauteren D. Influence des lipides sur les propriétés dynamiques du récepteur aux opioïdes µ. 2013. Poster session presented at 7 th Annual Meeting of the SFMBBM doctoral school, Liège, Belgium.